Les débouchés du master sont très variés, par exemple :
- structures de recherche (grands organismes de recherche, agences de recherche, laboratoires de recherche publique, centres de R&D de laboratoires privés ou d’entreprises) ;
 - pôles de compétitivité ;
 - collectivités publiques (services de l’État, régions, villes, conseils généraux, structures intercommunales) ;
 - services internationaux des universités, des villes, des régions, des collectivités publiques ;
 - structures déconcentrées de gestion de certains programmes européens ;
 - centres d’information et de formation sur les politiques européennes et les programmes européens ;
 - cabinets de conseil en innovation et projets européens, ou en financements européens pour les collectivités et les ONG ;
 - chambres de commerce et d’industries, organisations professionnelles, syndicats professionnels, comités d’expansion économique ;
 - ONG et associations ;
 - cabinets de lobbying ;
 - représentations de fédérations professionnelles ou de collectivités auprès de l’Union européenne, réseaux européens ;
 - institutions européennes (sur concours) ou organisations internationales.